“方尖碑”：在人類消化系統中發現了全新的生命類別

通過窺視生活在我們體內的微生物叢林，研究人員偶然發現了似乎是一類全新的類似病毒的物體。

“這太瘋狂了，”北卡羅來納大學細胞生物學家馬克·佩弗（Mark Peifer）說，他沒有參與這項研究。告訴伊麗莎白·彭尼西 （Elizabeth Pennisi） 在科學雜志.“我們看得越多，我們看到的東西就越瘋狂。”

這些神秘的遺傳物質沒有可檢測到的序列，甚至沒有任何其他生物制劑已知的結構相似性。

因此，斯坦福大學生物學家伊萬·澤魯德夫（Ivan Zheludev）及其同事認為，他們的奇怪發現可能不是病毒根本沒有，而是一組全新的實體，可能有助于彌合最簡單的遺傳分子和更復雜的病毒之間的古老差距。

“方尖碑由一類不同的RNA組成，這些RNA已經在人類和全球微生物群落中定植，并且被忽視了，”研究人員在預印本論文中書寫.

方尖碑以其扭曲的RNA長度形成的高度對稱的桿狀結構命名，其基因序列的大小只有1000個字符（核苷酸）左右。事實上，這種簡潔可能是我們以前沒有注意到它們的原因之一。

在一項尚未經過同行評審的研究中，Zheludev及其團隊搜索了540萬個已發表的基因序列數據集，并確定了近30,000個不同的方尖碑。它們出現在研究小組檢查的人類微生物組中約10%。

在一組數據中，方尖碑出現在50%的患者口腔樣本中。更重要的是，不同類型的方尖碑似乎存在于我們身體的不同部位。

“[這]支持方尖碑可能包括上述人類微生物組的殖民者的觀點，”研究人員解釋.

他們設法從我們的微生物組中分離出一種類型的宿主細胞，即細菌血鏈球菌s– 一種常見的人類口腔微生物。這些微生物中的方尖碑有一個長 1,137 個核苷酸的環。

“雖然我們不知道其他方尖碑的'宿主'，”寫Zheludev及其同事。“可以合理地假設細菌中可能存在至少一部分。

撇開方尖碑的來源問題不談，所有這些似乎都包含了一類新的蛋白質的代碼，研究人員將其命名為Oblins。

構建這些蛋白質的指令似乎至少占據了方尖碑遺傳物質的一半。由于這些蛋白質在所有方尖碑中都非常相似，研究人員懷疑它們可能參與了實體的復制過程。

這種編碼蛋白質的能力使它們不同于其他已知的稱為類病毒的RNA環，但它們似乎也沒有產生RNA病毒（包括新型冠狀病毒肺炎（COVID-19））在細胞外時生活在細胞內。

它們也比細胞內共存的其他遺傳分子大得多，從植物到細菌，稱為質 粒，它們通常由 DNA 組成。

然而，Zheludev和團隊無法確定方尖碑對細菌宿主的任何影響，也無法確定它們在細胞之間傳播的方式。

“這些元素甚至可能不是'病毒'，可能更類似于'RNA質粒'，”他們結束.

這項研究已上傳到預印本服務，生物Rxiv.

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